Вот после перезагрузки в директ админе такая картина с нагрузкой - очень много http запросов.
Пробуем решить проблему - уменьшаем время жизни длинных SQL запросов.
ищем файл my.cnf (/etc/my.cnf) - для настройки SQL баз.
Вставляем туда:
[mysqld]
datadir=/var/lib/mysql
socket=/var/lib/mysql/mysql.sock
user=mysql
symbolic-links=0
max_connections=200
max_user_connections=50
wait_timeout=30
interactive_timeout=50
long_query_time=5
#log-queries-not-using-indexes
#log-slow-queries=/var/log/mysql/log-slow-queries.log
[mysqld_safe]
log-error=/var/log/mysqld.log
pid-file=/var/run/mysqld/mysqld.pid