Прогоны абсолютно не будут вредны и никакого гнева. как вы выразились, опасаться не стоит
Единственное, что заранее определитесь с ключевыми запросами и составляйте описания для прогона уже на основании этих ключевиков. Т.к. многие новички, знаю, с этого форума делают ошибки: вначале обращаются к регистраторам, они даже сами помогают составить описания, сами подбирают непонятно какие ключевики и прогоняют сайт. А новичок потом смотрит, что толку то от этого прогона... маловато, скажем так. А потом продвигать по запросам уже приходится более серьезными и дорогими методами.
Так что вначале определяйтесь с ключевиками (wordstat.yandex.ru в помощь), т.к. только в этом случае прогон создаст вам базу для проведения дальнейшей работы.