В чем разница
 

скажите пожалуйста, в чем разница между прогонам по каталогам и прямыми ссылками?

Если вы не будет ставить на своем сайте обратные ссылки на каталоги, чего я вам не рекомендую настоятельно делать, то разницы никакой нет. Другой вопрос о тематичности ссылок, но это тема для отдельного разговора. А вообще, по собственному опыту скажу, что каталожными беками можно поднять много НЧ запросов. Другое дело, что каталоги частично банят перманентно, появляются новые, поэтому одного прогона раз и навсегда недостаточно. Надо периодически прогонять снова и снова.
Удачи в трудах!

да, в раскрутке сайтов надо постоянно бежать и бежать.. :) ибо поисковики становятся все умнее и умнее :)